Preparar, segmentar y comprobar
RM multimodal y verificación de los módulos posteriores con entradas controladas.
01 Inicio
Ilustración conceptual · sin datos de pacientesUB · UPC / Ingeniería Biomédica
Segmentación
de glioblastoma
en resonancia
magnética.
Para la evaluación del efecto de masa
02 Contexto
Cuatro modalidades
de resonancia magnética.
T1, T1 con contraste, T2 y FLAIR aportan información complementaria del mismo estudio.
El preprocesamiento establece una correspondencia espacial entre las cuatro modalidades antes de segmentar.
03 Regiones
Regiones tumorales
y efecto de masa.
WT: tumor completo · TC: núcleo tumoral · ET: componente realzante.
ET ⊂ TC ⊂ WTRegiones anidadas: sus volúmenes no se suman.
Línea mediaVentrículosCisternas
04 Objetivos
Objetivos
y alcance.
Desarrollar un flujo que integre segmentación, indicadores anatómicos e informe estructurado.
Adaptar e integrar indicadores
Base funcional de BTReport; línea media, ventrículos y cisternas.
Informar y permitir la revisión
Informe configurable, evidencia asociada y aplicación gráfica.
05 Arquitectura
Quince módulos.
Cuatro bloques.
- 01–04
Preparación
DICOM → NIfTI
Registro MNI · HD-BET - 05
Segmentación
BraTS23_1
WT · TC · ET - 06–11
Análisis
Anatomía · indicadores
Síntesis heurística - 12–15
Informe
Hechos · comprobación
Formulario médico
VP: verdaderos positivos · FP: falsos positivos · FN: falsos negativos.
EntradasTransformacionesMedicionesAdvertenciasInforme
Memoria final · tabla 3, figura 8 y §5.1–5.3 · pp. 17–20. BTReport: adaptación funcional.
06 Metodología
Tres series.
Tres preguntas.
A / Segmentación10casos
¿Qué correspondencia tiene la predicción?
Origen: conjunto de entrenamiento BraTS 2023. Diez casos consecutivos de una selección reproducible.
Entrada: RM multimodal. Predicción automática frente a máscara de referencia.
B / Integración5casos
¿Funciona el flujo posterior?
Origen: cinco casos públicos BraTS, recodificados FRESH-000 a FRESH-004. Máscaras de referencia registradas a MNI como entrada controlada.
C / Exploración3estudios
¿Puede ejecutarse en estudios hospitalarios?
Origen: Hospital Pablo Tobón Uribe. COL-000, COL-001 y COL-002; estudios anonimizados sin referencia experta independiente.
Procedencia y selección: memoria final · §5.1 y §7.1–7.3 · pp. 18–19 y 25–29.
07 Resultados
Resultados
técnicos.
10/10segmentaciones evaluadas
sin fallos ni exclusiones
sin fallos ni exclusiones
| Región | Dice ↑ | HD95, mm ↓ |
|---|---|---|
| WT | 0,971 ± 0,013 | 1,329 ± 0,385 |
| TC | 0,978 ± 0,010 | 1,165 ± 0,398 |
| ET | 0,947 ± 0,027 | 1,124 ± 0,200 |
Dice
Solapamiento entre predicción y referencia. Un valor de 1 indica coincidencia completa.
HD95
Percentil 95 de la distancia entre contornos. Se expresa en milímetros; menor es mejor.
5/5 casos de integración completos5/5 informes con comprobación interna superada43 ítems de revisión por caso
Los diez casos proceden del conjunto de entrenamiento BraTS 2023. Las métricas pueden ser optimistas; no son validación externa.
08 Hospital
Exploración
hospitalaria.
Registro: excelente
186,65 mlvolumen WT estimado
19,00 mmmáximo del trazo anatómico estimado
- Ventrículos
- Grave
- Cisternas
- Moderada
Mayor volumen y desplazamiento estimados en esta serie.
Tabla 8 · p. 36. Categorías algorítmicas; sin referencia experta independiente. El máximo estimado no equivale a una medición validada del septum pellucidum.
09 Trazabilidad
Del informe
a su evidencia.
Cada párrafo se contrasta con hechos permitidos y valores documentados.
- 01
Imagen y transformación
Entrada, máscara y geometría conservadas.
- 02
Medición y advertencia
Origen y estado de cada resultado.
- 03
Hecho identificable
Relación mediante
fact_id. - 04
Párrafo comprobado
Referencias admitidas y cifras respaldadas.
La comprobación interna puede aprobar un texto que hereda una medición incorrecta. La trazabilidad permite localizar el origen.
10 Alcance
Alcance
de la evidencia.
BTReport · línea transferida desde un atlas
La anotación del atlas MNI152 se deforma hacia la T1 del paciente mediante SynthMorph.
Referencia ideal: recta entre puntos anterior y posterior de la hoz por corte axial. Distancias vóxel a vóxel y resumen 3D.
SGEM · trazo estimado en la imagen
El módulo 06 busca un trazo continuo en un corredor central, con evidencia multimodal y penalización dentro del tumor.
Referencia teórica: línea recta derivada de MNI. Distancias laterales del trazo con soporte anatómico; máximo y percentil 95.
Ejemplos distintos: no comparar los milímetros de estas dos imágenes. El TFM no dispone de una comparación pareada; el máximo del trazo no equivale automáticamente a una medida en el septum pellucidum.
Comparación metodológica · TFM, tabla 2, §5.3 y §10.1; módulo 06 de SGEM · BTReport, §4.3 y figura 2.
11 Conclusiones
Conclusiones
vinculadas a los objetivos.
Preprocesamiento, segmentación y verificación
Flujo implementado; 10 segmentaciones evaluadas y 5 casos de integración completados.
Hallazgos e indicadores anatómicos
Adaptación funcional de BTReport e integración de línea media, ventrículos y cisternas. La comparación pareada de línea media queda como línea futura.
Informe estructurado y aplicación gráfica
Salidas configurables, evidencia trazable y revisión experta exploratoria desde una interfaz común.
Líneas futuras
Cohorte externa con referencias expertas; comparación pareada con BTReport y evaluación de concordancia y utilidad clínica.